Terhitung sejak 5 April 2018, STAIN Pamekasan akhirnya kembali bertransformasi menjadi IAIN Madura dengan mengelola enam fakuktas berbeda. Masing-masing Fakuktas Tarbiyah, Fakultas Syariah, Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam, Fakultas Ushuluddin, Fakultas Dakwah, serta Pascasarjana.
Matangkan Menuju UIN, IAIN Madura Tambah 3 Prodi Lagi
